近亲婚配后代患隐性遗传病的几率很高。乱伦对后代危害很大。不生育,符合年龄,有生育保健知识的,双方情愿的一般不会造成身心人格上的危害。根据生命是在遗传的基础上发生变异的原理,近亲结合会导致种族退化,会产生遗传病患儿或是畸形胎儿,且药物治疗作用浅在。从生育上讲,一般认为兄妹同胞间的危害最大,因为双方都来于同一父母,双方的遗传基因大都相似,导致后代无法变异,从而很可能产生严重遗传病。其次是父母与子女间的乱伦,实际上这种关系比兄妹同胞间的危害较小,因为孩子还携带着一半配偶的遗传基因,另一部分是自己原始的的,后代仍有可能还会发生变异,一般都是精神病人。
古人不明白这个道理,但是乱伦生下的孩子,都是异常,称之为天谴、作孽。所以以严苛的礼法加以约束,后来理学盛起,更加禁止。